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09:30 - 10:00 Accueil des participants 

10:00 - 10:10 Remarques introductives 

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10:10 - 11:45 Session 1 – Intégration des données multimodales en biologie et en cancérologie 

10:10 - 11:00 Conférencière principale n°1 | DR. ANDREA RAU
                       Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech

Titre: Relever les défis statistiques de l’intégration multi-omique 
Dr. Andrea Rau, experte en biostatistique et en biologie informatique, présentera des méthodologies de pointe pour l’intégration de données multi-omiques et soulignera les applications en oncologie.

11:00 - 11:45 3 présentations sélectionnées (15 minutes par présentation) 
                       Valentin Isen: How to get the most of your single-cell RNA-seq data? A practical walkthrough using follicular lymphoma stromal microenvironment
                       Hugo Barbot: Multi-omic statistical inference of cellular heterogeneity
                       FLASH TALKS:Jules Garreau (Network based analyses of transcriptomic data to study the effect of Sonic              Hedgehog pathway defect in neurodevelopmental disorders)
                                              Quentin Rouger (Naive prediction of complete protein complex structure using AlphaFold, applied  in Type 4 secretion system)
                                              Nicolaï Hoffmann (Facilitating genome annotation using ANNEXA and long-read RNA sequencing)
                                              Charlotte Dubec-Fleury (Targeted Segmentation of Macrophages Enhances Spatial Profiling in      Imaging Mass Cytometry)

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11:45 - 12:45 Pause déjeuner 

12:45 – 13:30 Posters | Toutes les sessions (café) 

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13:30 – 15:05 Session 2 – L’IA pour l’analyse de séquences et d’images 

13:30 - 14:20 Conférencière principale n°2 | DR. JULIETTE GRIFFIÉ
                       Science for Life Laboratory, Université de Stockholm, Suède

Titre: ML interprétable pour la conception thérapeutique et le diagnostic basés sur les données 
Dr. Juliette Griffié est spécialisée dans l’imagerie computationnelle et la modélisation biomédicale pilotée par l’IA. Son exposé portera sur les avancées récentes en matière d’analyse d’images de microscopie, d’IA générative et d’IA explicable en immunologie - applications en oncologie.

14:20 - 15:05 3 présentations sélectionnées (15 minutes par présentation) 
                       Rajeev Manick: sGAN: Enabling Low-Data, High-Speed Cell Classification for Automated Microscopes
                       Clémentine Hatton: Synthetic thoracic radiography generation for improved nodule detection
                       Sidi Mohamed Sid'El Moctar: On the Use of Flow Matching for Microtubule Segmentation in Noisy Microscopy Images

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15:05 – 15:40 Pause café 

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15:40– 17:15 Session 3 – Applications de l’IA et des approches intégratives dans le domaine de la médecine et de la santé personnalisées 

15:40 - 16:30 Conférencier principal n°3 |  DR. RÉMY NICOLLE
                       Centre de Recherche sur l’Inflammation, INSERM, CNRS, Université Paris Cité

Titre: Phénotypage tumoral multimodal pour la recommandation de traitement dans le cancer du pancréas 
Rémy Nicolle, expert renommé en onco-génomique et en recherche sur le cancer du pancréas, discutera des approches intégratives multimodales émergentes et des méthodologies d’IA pour la médecine personnalisée, en se concentrant sur la stratification des patients, la découverte de biomarqueurs et les stratégies thérapeutiques personnalisées dans le cancer du pancréas.

16:30 – 17:15 3 présentations sélectionnées (15 minutes par présentation) 
                       Axel Bonesteve: From clinical texts to phenotypic profiles: extraction of HPO terms to facilitate the characterisation and clustering of patients with rare diseases.
                       Tianyuan Wang: Multimodal Analysis of Fibrous Nests in Human Hepatocellular Carcinomas by Spatial Transcriptomics and a 62-Antibody Immune Oncology Multiplex Panel
                       Saiveth Hernandez-Hernandez: Integration of Extracellular Vesicle microRNA Signatures and Ma-chine Learning to Improve Lung Cancer Diagnosis

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17:15 – 17:30 Session de clôture - Orientations futures de la bioinformatique 

Remarques conclusives 

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17:30      Wine and Cheese 

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